sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-BR-A4QI	1	61735	10801777	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	10806866	12565259	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	12569021	15905987	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	15907908	18562348	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	18562985	19232033	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	19236571	21422975	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	21426777	33030742	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	33032412	34318524	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	34318790	38850997	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	38851673	41065744	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	41067309	65015252	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	65018240	67497878	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	67503666	67968725	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	67969617	68565210	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	68565512	83625968	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	83625994	84854614	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	84855655	121482979	1	1
TCGA-BR-A4QI	1	144007049	151409843	2	2
TCGA-BR-A4QI	1	151409986	153171148	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	153171183	154820067	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	154822209	163017741	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	163018505	165025722	2	2
TCGA-BR-A4QI	1	165025758	182336247	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	182336839	184748213	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	184749345	186316488	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	186316732	186875927	2	0
TCGA-BR-A4QI	1	186877211	200752115	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	200759934	202298108	3	1
TCGA-BR-A4QI	1	202298461	210929461	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	210929893	211411126	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	211415950	219265599	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	219269798	224489547	2	2
TCGA-BR-A4QI	1	224491748	225876063	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	225879995	226030324	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	226032052	229178319	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	229178358	229597960	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	229604689	233610160	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	233610399	234199521	5	1
TCGA-BR-A4QI	1	234199926	245063487	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	245067411	245486085	4	1
TCGA-BR-A4QI	1	245486231	246741105	2	1
TCGA-BR-A4QI	1	246744418	249224388	3	1
TCGA-BR-A4QI	2	12784	8486659	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	8487054	10791468	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	10791755	12878668	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	12881778	15145954	6	2
TCGA-BR-A4QI	2	15146466	21482292	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	21483555	23408640	3	3
TCGA-BR-A4QI	2	23409862	26952998	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	26953540	30377055	4	2
TCGA-BR-A4QI	2	30377534	32523169	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	32525846	33493333	9	2
TCGA-BR-A4QI	2	33493498	35653475	3	2
TCGA-BR-A4QI	2	35653722	37192866	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	37203510	37452268	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	37458355	45200661	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	45200900	47246899	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	47248196	47446888	6	1
TCGA-BR-A4QI	2	47449602	49732394	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	49734833	56978377	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	56978564	63630260	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	63630837	64212972	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	64213671	73829372	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	73831074	75092561	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	75092774	85897919	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	85898143	87996372	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	88024667	115112328	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	115112543	118444283	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	118444315	160428401	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	160430127	162677595	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	162678462	165324532	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	165329104	166819761	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	166834136	169027539	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	169027555	171325374	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	171326321	176572769	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	176579792	177086293	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	177087020	183304603	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	183304777	186684734	2	2
TCGA-BR-A4QI	2	186689559	200649191	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	200651108	202473078	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	202481531	215286243	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	215287172	216907372	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	216908679	227415555	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	227415994	227559414	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	227562139	236465074	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	236470862	236709988	5	1
TCGA-BR-A4QI	2	236711920	239112603	2	1
TCGA-BR-A4QI	2	239113103	239441987	4	1
TCGA-BR-A4QI	2	239445618	243089456	2	1
TCGA-BR-A4QI	3	60345	11055338	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	11055624	12189968	3	0
TCGA-BR-A4QI	3	12192394	12494794	6	0
TCGA-BR-A4QI	3	12498401	13895187	3	0
TCGA-BR-A4QI	3	13895806	15589591	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	15590432	26061386	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	26062453	27782673	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	27783089	37060814	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	37062854	37359941	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	37368333	48972703	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	48972892	52309379	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	52320912	56491294	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	56500135	58232530	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	58232618	62929692	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	62933444	63300377	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	63306819	71812346	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	71816429	72737068	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	72738160	82981094	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	82982088	83906468	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	83907013	97956985	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	97957115	99065296	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	99070604	107176378	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	107177823	108141003	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	108141540	132387777	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	132399782	133511351	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	133512059	137268227	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	137273120	138192274	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	138193244	138843846	9	0
TCGA-BR-A4QI	3	138846283	154082012	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	154082815	157314208	7	0
TCGA-BR-A4QI	3	157314913	166493167	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	166493282	166673101	11	0
TCGA-BR-A4QI	3	166676839	169358514	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	169365545	171055859	9	0
TCGA-BR-A4QI	3	171056156	178153688	5	0
TCGA-BR-A4QI	3	178155035	178362643	2	0
TCGA-BR-A4QI	3	178365463	178480704	4	0
TCGA-BR-A4QI	3	178482022	197896118	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	12281	9378279	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	9380944	10453525	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	10454994	61767946	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	61769478	63113535	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	63118453	80784995	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	80788782	81057460	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	81060836	97462794	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	97463101	98035538	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	98041269	112641738	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	112644720	112906217	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	112908297	121156600	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	121160084	122808683	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	122809038	124021417	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	124021626	124606970	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	124607201	143225154	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	143228504	145173306	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	145180757	151668146	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	151673763	152567910	4	0
TCGA-BR-A4QI	4	152572995	160692060	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	160692288	162803104	3	0
TCGA-BR-A4QI	4	162803426	181562135	2	0
TCGA-BR-A4QI	4	181562629	181749004	5	0
TCGA-BR-A4QI	4	181749157	191027923	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	15532	1479678	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	1487663	1826047	9	0
TCGA-BR-A4QI	5	1826075	2684139	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	2685567	16423462	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	16426383	16656570	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	16656803	18241216	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	18248486	18404829	11	0
TCGA-BR-A4QI	5	18405744	21649826	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	21654027	22311986	16	0
TCGA-BR-A4QI	5	22314300	30931839	8	0
TCGA-BR-A4QI	5	30932345	32592736	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	32592961	32820270	13	0
TCGA-BR-A4QI	5	32821302	35481647	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	35482314	36373504	9	0
TCGA-BR-A4QI	5	36373756	37941987	15	0
TCGA-BR-A4QI	5	37944529	40516643	7	0
TCGA-BR-A4QI	5	40517331	49587801	6	0
TCGA-BR-A4QI	5	49588732	63603540	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	63603810	67203790	3	0
TCGA-BR-A4QI	5	67203790	67699988	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	67702380	72346520	3	0
TCGA-BR-A4QI	5	72347070	74984619	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	74985610	75189298	10	0
TCGA-BR-A4QI	5	75191692	140570472	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	140571178	142160495	3	0
TCGA-BR-A4QI	5	142162633	143694127	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	143696027	143984109	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	143986998	147422010	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	147427498	150290651	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	150296477	152785058	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	152785872	152941091	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	152948254	153113743	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	153113959	154252773	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	154254818	162165287	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	162165571	162317234	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	162320479	162867195	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	162869215	165107100	5	0
TCGA-BR-A4QI	5	165107127	172682953	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	172682985	173543841	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	173545602	176517732	2	0
TCGA-BR-A4QI	5	176517746	178397804	4	0
TCGA-BR-A4QI	5	178402407	180790320	2	0
TCGA-BR-A4QI	6	149661	2453551	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	2455129	3415447	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	3416606	3616763	5	1
TCGA-BR-A4QI	6	3622751	24545254	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	24545307	26158079	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	26158993	27856280	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	27858421	28881660	10	2
TCGA-BR-A4QI	6	28892919	30065575	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	30066031	31162520	4	2
TCGA-BR-A4QI	6	31162963	39824567	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	39827804	40269741	4	2
TCGA-BR-A4QI	6	40270047	41945550	7	2
TCGA-BR-A4QI	6	41946616	42210276	12	1
TCGA-BR-A4QI	6	42210390	44253391	6	2
TCGA-BR-A4QI	6	44253749	47695002	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	47695112	51509992	3	3
TCGA-BR-A4QI	6	51512310	55895876	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	55898843	57414493	7	2
TCGA-BR-A4QI	6	57414509	61949555	3	3
TCGA-BR-A4QI	6	61962715	62493307	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	62493865	64006469	5	1
TCGA-BR-A4QI	6	64007797	64595973	6	1
TCGA-BR-A4QI	6	64603334	86033032	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	86034536	90771201	2	2
TCGA-BR-A4QI	6	90771796	91455484	4	1
TCGA-BR-A4QI	6	91461345	125097304	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	125097427	126761527	3	2
TCGA-BR-A4QI	6	126764190	128064376	2	1
TCGA-BR-A4QI	6	128065215	128808076	4	1
TCGA-BR-A4QI	6	128811058	130877694	3	3
TCGA-BR-A4QI	6	130878040	131148426	7	2
TCGA-BR-A4QI	6	131148863	132289213	3	3
TCGA-BR-A4QI	6	132289424	133890157	5	2
TCGA-BR-A4QI	6	133890195	135244879	6	2
TCGA-BR-A4QI	6	135246294	135745016	10	2
TCGA-BR-A4QI	6	135752608	143411762	5	2
TCGA-BR-A4QI	6	143414795	157197243	2	0
TCGA-BR-A4QI	6	157197469	159119811	3	0
TCGA-BR-A4QI	6	159119979	159487391	6	0
TCGA-BR-A4QI	6	159487455	163855065	3	0
TCGA-BR-A4QI	6	163856782	165289033	7	0
TCGA-BR-A4QI	6	165289461	171051005	3	0
TCGA-BR-A4QI	7	43259	2825922	3	2
TCGA-BR-A4QI	7	2826444	11790644	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	11791774	11841781	3	0
TCGA-BR-A4QI	7	11841801	19575505	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	19575555	20957582	4	4
TCGA-BR-A4QI	7	20961711	32672522	3	2
TCGA-BR-A4QI	7	32674150	33138875	5	4
TCGA-BR-A4QI	7	33139147	52225280	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	52225399	54414731	4	3
TCGA-BR-A4QI	7	54414825	63271931	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	63273528	65916918	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	65919648	67923495	5	1
TCGA-BR-A4QI	7	67924433	77566730	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	77572034	86234885	1	1
TCGA-BR-A4QI	7	86235088	92490040	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	92490092	94268266	3	2
TCGA-BR-A4QI	7	94271434	99133682	2	1
TCGA-BR-A4QI	7	99137188	100779305	3	3
TCGA-BR-A4QI	7	100779871	104057456	2	2
TCGA-BR-A4QI	7	104057895	111639942	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	111641576	113873107	6	0
TCGA-BR-A4QI	7	113876586	115563547	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	115563547	117233407	4	0
TCGA-BR-A4QI	7	117234176	127956911	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	127957320	131526841	4	0
TCGA-BR-A4QI	7	131527010	142792045	2	0
TCGA-BR-A4QI	7	142792658	155542408	1	0
TCGA-BR-A4QI	7	155543806	158827040	3	0
TCGA-BR-A4QI	7	158827326	159127004	1	0
TCGA-BR-A4QI	8	31254	27549421	1	0
TCGA-BR-A4QI	8	27551073	27809387	2	0
TCGA-BR-A4QI	8	27810000	30219110	3	0
TCGA-BR-A4QI	8	30219809	31126376	2	0
TCGA-BR-A4QI	8	31126442	38817412	1	0
TCGA-BR-A4QI	8	38821665	39524550	10	1
TCGA-BR-A4QI	8	39528212	41006048	4	1
TCGA-BR-A4QI	8	41010276	43696756	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	43701112	52069488	4	0
TCGA-BR-A4QI	8	52072991	57299586	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	57299697	57659644	5	4
TCGA-BR-A4QI	8	57659691	60334071	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	60336290	61860434	11	2
TCGA-BR-A4QI	8	61860596	64371403	6	2
TCGA-BR-A4QI	8	64387107	76228295	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	76229859	77659428	8	2
TCGA-BR-A4QI	8	77661750	78632893	4	3
TCGA-BR-A4QI	8	78633891	88807171	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	88811754	89169780	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	89170077	100776943	2	2
TCGA-BR-A4QI	8	100777888	102419151	5	2
TCGA-BR-A4QI	8	102421729	122761818	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	122762938	123294995	6	2
TCGA-BR-A4QI	8	123297343	126328512	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	126328695	135676839	2	2
TCGA-BR-A4QI	8	135678804	135886623	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	135888945	138746389	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	138746890	138933940	5	3
TCGA-BR-A4QI	8	138934562	141447534	3	2
TCGA-BR-A4QI	8	141457201	142689315	4	2
TCGA-BR-A4QI	8	142689804	144777242	6	2
TCGA-BR-A4QI	8	144777467	146298155	3	2
TCGA-BR-A4QI	9	46587	2700991	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	2701429	4206571	2	0
TCGA-BR-A4QI	9	4206671	6756149	3	0
TCGA-BR-A4QI	9	6760217	13832491	2	0
TCGA-BR-A4QI	9	13832587	15374609	4	0
TCGA-BR-A4QI	9	15378192	25592656	2	0
TCGA-BR-A4QI	9	25597965	26027346	9	2
TCGA-BR-A4QI	9	26030586	26205604	3	3
TCGA-BR-A4QI	9	26205694	36210411	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	36212440	36712494	5	2
TCGA-BR-A4QI	9	36714252	47217176	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	65616971	73556582	1	0
TCGA-BR-A4QI	9	73556679	103375024	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	103375209	106797735	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	106798307	116154099	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	116159423	117834840	5	1
TCGA-BR-A4QI	9	117834941	118070259	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	118073376	118224299	5	1
TCGA-BR-A4QI	9	118228498	130554998	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	130558675	132538934	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	132539989	137434799	2	1
TCGA-BR-A4QI	9	137435597	139705676	2	2
TCGA-BR-A4QI	9	139711458	141091394	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	72759	5445958	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	5446794	5847683	8	1
TCGA-BR-A4QI	10	5848001	10817922	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	10818087	10990621	8	1
TCGA-BR-A4QI	10	10992821	21358257	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	21360700	21868875	8	1
TCGA-BR-A4QI	10	21874526	24838291	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	24838291	25615607	4	4
TCGA-BR-A4QI	10	25620958	32088412	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	32091885	32846437	9	1
TCGA-BR-A4QI	10	32859492	39076221	5	1
TCGA-BR-A4QI	10	42433540	53591012	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	53591234	56028635	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	56033577	56197191	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	56197903	62196336	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	62196856	62575212	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	62575305	63740913	3	3
TCGA-BR-A4QI	10	63744609	66279839	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	66281499	68958113	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	68958566	71225534	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	71226444	73367355	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	73369637	77819030	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	77819200	95966855	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	95969913	97961494	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	97962687	118156579	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	118160043	119250140	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	119250211	123973846	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	123974428	128613618	2	1
TCGA-BR-A4QI	10	128614351	129567448	1	1
TCGA-BR-A4QI	10	129569199	129835195	4	1
TCGA-BR-A4QI	10	129835928	135506704	1	1
TCGA-BR-A4QI	11	198572	12795662	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	12796525	15130643	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	15132678	15369048	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	15372794	16049452	6	0
TCGA-BR-A4QI	11	16054913	16774594	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	16775254	18970748	5	0
TCGA-BR-A4QI	11	18971175	26521287	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	26521495	27053592	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	27059105	28291582	7	0
TCGA-BR-A4QI	11	28292078	29179810	9	0
TCGA-BR-A4QI	11	29179958	34353070	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	34353226	42735882	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	42738308	46562102	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	46568309	56865416	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	56865569	68705183	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	68710847	69852240	5	0
TCGA-BR-A4QI	11	69854718	77335236	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	77335336	77902589	5	0
TCGA-BR-A4QI	11	77903098	86611166	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	86612582	88076855	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	88080233	90966152	1	0
TCGA-BR-A4QI	11	90966816	108421163	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	108424496	108745874	4	0
TCGA-BR-A4QI	11	108746488	115804408	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	115807289	118886117	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	118886921	126917136	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	126917380	132832873	3	0
TCGA-BR-A4QI	11	132837688	134021798	2	0
TCGA-BR-A4QI	11	134022023	134944770	1	0
TCGA-BR-A4QI	12	150442	417633	2	0
TCGA-BR-A4QI	12	417691	1554962	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	1562689	3059623	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	3064095	13892408	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	13892523	14262255	2	2
TCGA-BR-A4QI	12	14262545	15092569	3	3
TCGA-BR-A4QI	12	15093453	29825617	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	29826248	30439329	5	1
TCGA-BR-A4QI	12	30447108	32357524	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	32358237	33073803	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	33073853	39421767	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	39427154	46739709	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	46742735	48635715	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	48637362	53459101	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	53459881	55531100	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	55536669	55840822	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	55844172	55977145	9	1
TCGA-BR-A4QI	12	55990098	56765506	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	56768272	62381242	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	62387775	62621985	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	62627436	78128887	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	78129877	80480742	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	80481985	88096173	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	88096436	88360244	2	1
TCGA-BR-A4QI	12	88360430	106744485	1	1
TCGA-BR-A4QI	12	106751629	118518479	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	118519416	119316699	7	1
TCGA-BR-A4QI	12	119317196	124995478	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	124996220	125287648	4	1
TCGA-BR-A4QI	12	125289265	125514717	8	1
TCGA-BR-A4QI	12	125515832	127307103	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	127307651	127654126	3	3
TCGA-BR-A4QI	12	127654570	132406659	3	1
TCGA-BR-A4QI	12	132407202	132690868	6	1
TCGA-BR-A4QI	12	132693487	133778189	3	1
TCGA-BR-A4QI	13	19026949	25779565	2	2
TCGA-BR-A4QI	13	25779937	26585122	3	2
TCGA-BR-A4QI	13	26585224	26797521	6	2
TCGA-BR-A4QI	13	26798118	29984937	3	2
TCGA-BR-A4QI	13	29985483	32923611	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	32923690	33134047	6	0
TCGA-BR-A4QI	13	33134942	33600233	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	33600277	33699406	6	0
TCGA-BR-A4QI	13	33699655	49238044	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	49239304	51399953	6	0
TCGA-BR-A4QI	13	51401993	77376631	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	77380705	77556325	5	0
TCGA-BR-A4QI	13	77557094	103230454	3	0
TCGA-BR-A4QI	13	103233342	103429168	7	0
TCGA-BR-A4QI	13	103429480	115108397	3	0
TCGA-BR-A4QI	14	19002124	21828045	2	2
TCGA-BR-A4QI	14	21828073	29823826	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	29824131	29914167	5	1
TCGA-BR-A4QI	14	29915103	32276137	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	32279959	33597881	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	33598868	37119254	6	1
TCGA-BR-A4QI	14	37119892	38049107	7	1
TCGA-BR-A4QI	14	38051911	39785583	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	39786159	49724953	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	49726115	51442630	7	1
TCGA-BR-A4QI	14	51442670	64696389	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	64696421	65119839	6	0
TCGA-BR-A4QI	14	65121102	67193453	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	67197735	69357175	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	69357265	70803097	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	70803640	72217881	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	72218104	74416836	3	1
TCGA-BR-A4QI	14	74420440	77069553	6	1
TCGA-BR-A4QI	14	77071408	78139915	4	1
TCGA-BR-A4QI	14	78145530	85745964	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	85746316	86989828	3	2
TCGA-BR-A4QI	14	86992137	92019783	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	92019797	92389372	4	1
TCGA-BR-A4QI	14	92389429	98789103	2	1
TCGA-BR-A4QI	14	98791107	98939601	4	1
TCGA-BR-A4QI	14	98939976	107285437	2	1
TCGA-BR-A4QI	15	20016328	32770460	1	0
TCGA-BR-A4QI	15	32776211	34390211	2	0
TCGA-BR-A4QI	15	34397513	43400759	1	0
TCGA-BR-A4QI	15	43402390	45100852	2	1
TCGA-BR-A4QI	15	45105374	45573489	5	2
TCGA-BR-A4QI	15	45574588	45652889	5	3
TCGA-BR-A4QI	15	45658982	47970548	3	1
TCGA-BR-A4QI	15	47971451	74881815	1	1
TCGA-BR-A4QI	15	74882968	78494344	2	1
TCGA-BR-A4QI	15	78501971	88143213	1	1
TCGA-BR-A4QI	15	88143647	88785838	4	1
TCGA-BR-A4QI	15	88786829	91335762	6	1
TCGA-BR-A4QI	15	91339415	92622948	3	2
TCGA-BR-A4QI	15	92623012	92814552	5	1
TCGA-BR-A4QI	15	92814603	93478180	3	1
TCGA-BR-A4QI	15	93479798	93681085	8	1
TCGA-BR-A4QI	15	93681351	96910440	4	1
TCGA-BR-A4QI	15	96913436	97099154	9	1
TCGA-BR-A4QI	15	97101095	98296476	5	1
TCGA-BR-A4QI	15	98296741	102469040	2	1
TCGA-BR-A4QI	16	60777	5585852	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	5586594	6231718	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	6231876	6763455	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	6763750	7538652	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	7539452	10629993	1	0
TCGA-BR-A4QI	16	10631912	11157286	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	11159172	12332682	4	0
TCGA-BR-A4QI	16	12332889	12669395	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	12670588	13034627	5	0
TCGA-BR-A4QI	16	13034833	13180387	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	13184816	13255874	6	0
TCGA-BR-A4QI	16	13261458	13343235	5	0
TCGA-BR-A4QI	16	13343272	13602656	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	13607568	13906889	5	0
TCGA-BR-A4QI	16	13914062	14642805	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	14646868	18643217	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	18665840	23237481	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	23239908	25269992	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	25270273	26643222	5	0
TCGA-BR-A4QI	16	26643949	35283226	3	0
TCGA-BR-A4QI	16	46463782	60325961	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	60328350	62691744	0	0
TCGA-BR-A4QI	16	62697140	66119176	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	66119821	68376832	6	0
TCGA-BR-A4QI	16	68377456	78343738	4	0
TCGA-BR-A4QI	16	78343936	78548574	7	0
TCGA-BR-A4QI	16	78548656	83912966	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	83917827	84098388	4	0
TCGA-BR-A4QI	16	84098615	89400929	2	0
TCGA-BR-A4QI	16	89402234	90287535	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	526	2178154	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	2180762	15872074	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	15872975	18012775	6	0
TCGA-BR-A4QI	17	18013803	25276327	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	25282105	25404661	0	0
TCGA-BR-A4QI	17	25409526	28579270	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	28579320	29106764	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	29107708	31654683	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	31655789	32281805	4	2
TCGA-BR-A4QI	17	32283793	32869382	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	32871575	32960300	4	2
TCGA-BR-A4QI	17	32966723	33802156	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	33802403	34014207	5	1
TCGA-BR-A4QI	17	34015097	35504150	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	35511983	36103565	3	2
TCGA-BR-A4QI	17	36103872	37673703	3	3
TCGA-BR-A4QI	17	37682657	38029338	8	2
TCGA-BR-A4QI	17	38031349	41674588	4	4
TCGA-BR-A4QI	17	41675445	42803002	2	2
TCGA-BR-A4QI	17	42805875	43183420	4	3
TCGA-BR-A4QI	17	43185820	45965966	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	45969605	47475007	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	47477146	50877789	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	50877789	54287678	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	54288766	55165432	3	0
TCGA-BR-A4QI	17	55165612	61166086	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	61167551	63741645	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	63742047	76131135	2	0
TCGA-BR-A4QI	17	76132259	78023722	8	0
TCGA-BR-A4QI	17	78026895	78230743	4	0
TCGA-BR-A4QI	17	78238218	81049726	2	0
TCGA-BR-A4QI	18	48133	2316089	2	1
TCGA-BR-A4QI	18	2316585	4928571	2	2
TCGA-BR-A4QI	18	4928710	21110278	2	1
TCGA-BR-A4QI	18	21112774	24493009	2	2
TCGA-BR-A4QI	18	24493053	25271194	6	1
TCGA-BR-A4QI	18	25273373	36637226	2	0
TCGA-BR-A4QI	18	36638908	36903623	4	0
TCGA-BR-A4QI	18	36907642	61747395	2	0
TCGA-BR-A4QI	18	61747828	63627546	4	0
TCGA-BR-A4QI	18	63628442	78015057	2	0
TCGA-BR-A4QI	19	90910	575083	2	2
TCGA-BR-A4QI	19	579100	2114284	3	2
TCGA-BR-A4QI	19	2123039	2538713	5	1
TCGA-BR-A4QI	19	2546168	3134699	3	2
TCGA-BR-A4QI	19	3143283	12853665	2	2
TCGA-BR-A4QI	19	12855099	13686262	4	2
TCGA-BR-A4QI	19	13690632	32055572	2	2
TCGA-BR-A4QI	19	32058893	33365430	2	1
TCGA-BR-A4QI	19	33365773	33569500	2	0
TCGA-BR-A4QI	19	33570263	34583201	8	1
TCGA-BR-A4QI	19	34583658	36484732	6	1
TCGA-BR-A4QI	19	36489977	44402893	1	0
TCGA-BR-A4QI	19	44407743	44613177	4	0
TCGA-BR-A4QI	19	44613443	44642053	8	2
TCGA-BR-A4QI	19	44642181	46854709	11	1
TCGA-BR-A4QI	19	46860058	47293331	6	0
TCGA-BR-A4QI	19	47299819	47377304	2	1
TCGA-BR-A4QI	19	47379553	51800341	1	1
TCGA-BR-A4QI	19	51801616	59097854	2	1
TCGA-BR-A4QI	20	61305	17845526	2	0
TCGA-BR-A4QI	20	17846386	19299390	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	19300148	21219686	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	21220212	36516451	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	36518403	39393556	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	39395210	54737536	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	54737680	55732763	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	55732901	56863437	4	4
TCGA-BR-A4QI	20	56863469	57260920	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	57263648	59011633	2	2
TCGA-BR-A4QI	20	59012309	60862390	4	2
TCGA-BR-A4QI	20	60867781	62956153	2	2
TCGA-BR-A4QI	21	10736871	15448560	1	0
TCGA-BR-A4QI	21	15448599	21863565	0	0
TCGA-BR-A4QI	21	21866386	33505090	2	0
TCGA-BR-A4QI	21	33505998	33877238	4	0
TCGA-BR-A4QI	21	33877556	35808989	2	0
TCGA-BR-A4QI	21	35812627	37169189	4	3
TCGA-BR-A4QI	21	37169381	37874975	6	3
TCGA-BR-A4QI	21	37878964	37900600	7	1
TCGA-BR-A4QI	21	37904192	48096957	2	0
TCGA-BR-A4QI	22	16052528	19146175	2	0
TCGA-BR-A4QI	22	19147424	22398670	4	0
TCGA-BR-A4QI	22	22398726	37787325	2	0
TCGA-BR-A4QI	22	37789974	38494164	4	0
TCGA-BR-A4QI	22	38500382	51234455	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	168477	30401343	1	0
TCGA-BR-A4QI	X	30402866	31209812	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	31210394	47100732	1	0
TCGA-BR-A4QI	X	47101198	48078937	4	0
TCGA-BR-A4QI	X	48082766	55368262	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	55368839	55786521	6	0
TCGA-BR-A4QI	X	55789661	71433809	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	71440029	96932047	3	0
TCGA-BR-A4QI	X	96932550	97074770	4	0
TCGA-BR-A4QI	X	97080344	98364102	3	0
TCGA-BR-A4QI	X	98364121	98849089	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	98857982	104134207	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	104142916	104352596	5	1
TCGA-BR-A4QI	X	104357762	104416590	6	1
TCGA-BR-A4QI	X	104421758	105910501	8	0
TCGA-BR-A4QI	X	105911921	111203971	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	111215692	117419561	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	117423387	119139240	5	0
TCGA-BR-A4QI	X	119149013	122965992	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	122971404	125858328	6	0
TCGA-BR-A4QI	X	125860130	126220179	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	126232061	128132697	6	0
TCGA-BR-A4QI	X	128132851	128250109	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	128250597	128421763	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	128428370	129251524	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	129256405	130854499	1	0
TCGA-BR-A4QI	X	130856964	132752365	3	0
TCGA-BR-A4QI	X	132762934	132783433	10	1
TCGA-BR-A4QI	X	132785912	133791992	5	0
TCGA-BR-A4QI	X	133797249	140782446	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	140783054	141680886	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	141682806	142750035	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	142751471	144292750	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	144294200	146382128	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	146385061	147141478	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	147150117	147725390	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	147725728	147942080	0	0
TCGA-BR-A4QI	X	147944133	151817181	2	0
TCGA-BR-A4QI	X	151818008	155233846	3	0
